藻类、藻毒素
它是一种肝毒素，具有强烈的促癌（肝癌）作用，长期饮用了含藻毒素的水后，会出现腹泻、乏力、厌食、呕吐、嗜睡、口眼分泌物增多等症状，皮肤接触含藻毒素水体可引起敏感部位(如眼睛)和皮肤过敏，流行病学研究发现饮水中微量微囊藻毒素与人群中原发性肝癌的发病率有很大相关性。
铁锈等重金属
这些重金属在水中不能被分解，人饮用后毒性放大，与水中的其他毒素结合生成毒性更大的有机物，一但进入人体很难排除。可引起人的头痛、头晕、失眠、健忘、神精错乱、关节疼痛、结石等常见疾病，积累多时，对儿童造成智力低下；对中年人造成记忆力减退；对老年人造成痴呆，诱发各种慢性疾病及癌变。
3、退伍军人杆菌（军团杆菌）：肺部杀手军团菌是人类肺炎的病原，可能导致致死性肺部感染。自来水水管用久后，发生生锈、藏有沉淀物等在水管中会藏匿军团菌。军团病是由军团杆菌引起一种非常严重的、有时可以致命的肺炎。人工供水系统为军团杆菌的大量繁殖提供生存环境，所以清洗水管非常必要。
4、病性大肠杆菌：释放一种强烈的毒素，并可能导致肠管出现严重症状，包括严重的水泻、带血腹泻、发烧、腹绞痛及呕吐。湖南净管家
5、霉菌：霉菌毒素：通过食品或饮用水可引起人急性或慢性中毒，表现为肝中毒、肾中毒、神经中毒和光致敏皮炎毒等。霉菌除了会直接引起中毒，或产生致癌物质，毒害人体外，还在人体内繁殖，引起霉菌性肺炎等疾病。或者引起的过敏性疾病，如支气管哮喘、皮炎等。除急性中毒外，霉菌毒素的致癌作用对人类健康危害最大。
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