清洗水管添加了柠檬酸并不会有危害的。
因为柠檬酸是一种弱酸，并不具备毒性。而水垢的主要成分是碳酸盐，在高温条件下，柠檬酸与其会发生化学反应，形成酸碱中和，水垢就会溶于酸，达到去除水垢目的，而且某些食品中加入柠檬酸后口感好，并可促进食欲，在中国是允许果酱、饮料、罐头和糖果中使用柠檬酸。所以不用太过担心，柠檬酸对人体影响。
不过使用柠檬酸时要记住其与水的配比是1:99，切勿过度使用，特别是食用带有柠檬酸的食品要切记适量，过量使用因为柠檬酸会促进人体内钙的排泄和沉积，可能会导致低血钙等症状。
柠檬酸用途可谓十分的广泛。柠檬酸产量的70％用作食品制造的调味剂。柠檬酸主要用作清凉饮料、果汁、果酱、水果糖和罐头等的酸性调味剂，也可用作食用油的抗氧化剂。无水柠檬酸大量用于固体饮料。柠檬酸的盐类如柠檬酸钙和柠檬酸铁是某些食品中需要添加钙离子和铁离子的强化剂。在我国，规定允许使用的酸化剂有醋酸、柠檬酸、柠檬酸钾、乳酸、酒石酸等17种。其中柠檬酸是使用较为广泛的一种酸化剂。作为酸化剂及添加剂，国家标准中并没对其进行限量使用，世界粮农组织（FAO）和世界卫生组织（WHO）通告的每日允许食用量（ADI）也未对其加以限量使用。水管清洗添加食用级柠檬酸水没有危害的而且还有杀菌消毒软化水管的作用。
使用可食用柠檬酸做添加剂清洗家庭自来水管可以根据现场清洗出来的污水，依照颜色可以将其分为五大类，分别为：含有污泥、菌藻类、重金属的黑色污水；含铁锈、重金属的咖啡色污水；含有菌藻类的粉绿色污水(与使用铜管而造成的绿色略有不同)；含有大量菌藻类、重金属的粘稠深咖啡色污水(又称中药浓汤色)；最后是含杂菌类的乳白色污水。
颜色浓淡同时受水质、水压、水管长度等因素营养而有所不同。一般而言，水压较高的小区住宅管路，因为压强原因沉淀污泥较少，主要积垢以藻类植物、细菌为主，因此洗出来颜色会比较淡。
另外，如果塑料水管的材质不能很好的隔光，长期的氧渗透容易使管道内长出类似青苔的绿色水藻，加上如果用户平时用水频率低，水龙头又开得不大，水在管道停留的时间一久，里面的杂质就越积越多，又冲不出来。一般楼层越高。接触的光越多，水藻生长得也快。
